Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms