Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q5

Clic1, Chloride intracellular channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic1Q9Z1Q5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clic1Q9Z1Q5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms