Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lgr5Q9Z1P4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lgr5Q9Z1P4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lgr5Q9Z1P4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lgr5Q9Z1P4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lgr5Q9Z1P4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lgr5Q9Z1P4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lgr5Q9Z1P4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lgr5Q9Z1P4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lgr5Q9Z1P4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lgr5Q9Z1P4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lgr5Q9Z1P4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Lgr5Q9Z1P4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lgr5Q9Z1P4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lgr5Q9Z1P4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Lgr5Q9Z1P4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Lgr5Q9Z1P4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lgr5Q9Z1P4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Lgr5Q9Z1P4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lgr5Q9Z1P4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lgr5Q9Z1P4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lgr5Q9Z1P4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lgr5Q9Z1P4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lgr5Q9Z1P4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lgr5Q9Z1P4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lgr5Q9Z1P4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lgr5Q9Z1P4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lgr5Q9Z1P4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Lgr5Q9Z1P4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lgr5Q9Z1P4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lgr5Q9Z1P4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms