Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z139

Ror1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ror1Q9Z139 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ror1Q9Z139 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms