Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms