Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms