Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E2

Chrd, Chordin, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChrdQ9Z0E2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChrdQ9Z0E2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChrdQ9Z0E2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChrdQ9Z0E2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChrdQ9Z0E2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChrdQ9Z0E2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChrdQ9Z0E2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChrdQ9Z0E2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChrdQ9Z0E2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChrdQ9Z0E2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChrdQ9Z0E2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChrdQ9Z0E2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChrdQ9Z0E2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChrdQ9Z0E2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChrdQ9Z0E2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChrdQ9Z0E2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChrdQ9Z0E2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChrdQ9Z0E2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChrdQ9Z0E2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChrdQ9Z0E2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChrdQ9Z0E2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChrdQ9Z0E2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ChrdQ9Z0E2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChrdQ9Z0E2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChrdQ9Z0E2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChrdQ9Z0E2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChrdQ9Z0E2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChrdQ9Z0E2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChrdQ9Z0E2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChrdQ9Z0E2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChrdQ9Z0E2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChrdQ9Z0E2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChrdQ9Z0E2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChrdQ9Z0E2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChrdQ9Z0E2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChrdQ9Z0E2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChrdQ9Z0E2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChrdQ9Z0E2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChrdQ9Z0E2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChrdQ9Z0E2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChrdQ9Z0E2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ChrdQ9Z0E2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChrdQ9Z0E2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChrdQ9Z0E2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChrdQ9Z0E2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ChrdQ9Z0E2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChrdQ9Z0E2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChrdQ9Z0E2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChrdQ9Z0E2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChrdQ9Z0E2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ChrdQ9Z0E2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ChrdQ9Z0E2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ChrdQ9Z0E2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ChrdQ9Z0E2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms