Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms