Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PapolbQ9WVP6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PapolbQ9WVP6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PapolbQ9WVP6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PapolbQ9WVP6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PapolbQ9WVP6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
PapolbQ9WVP6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PapolbQ9WVP6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PapolbQ9WVP6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PapolbQ9WVP6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PapolbQ9WVP6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PapolbQ9WVP6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PapolbQ9WVP6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PapolbQ9WVP6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PapolbQ9WVP6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PapolbQ9WVP6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PapolbQ9WVP6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PapolbQ9WVP6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PapolbQ9WVP6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PapolbQ9WVP6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PapolbQ9WVP6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PapolbQ9WVP6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PapolbQ9WVP6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PapolbQ9WVP6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PapolbQ9WVP6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PapolbQ9WVP6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PapolbQ9WVP6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PapolbQ9WVP6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PapolbQ9WVP6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PapolbQ9WVP6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PapolbQ9WVP6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PapolbQ9WVP6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PapolbQ9WVP6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PapolbQ9WVP6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PapolbQ9WVP6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PapolbQ9WVP6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PapolbQ9WVP6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PapolbQ9WVP6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms