Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUM3

Coro1b, Coronin-1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Coro1bQ9WUM3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Coro1bQ9WUM3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms