Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lemd3Q9WU40 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lemd3Q9WU40 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lemd3Q9WU40 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lemd3Q9WU40 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lemd3Q9WU40 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Lemd3Q9WU40 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lemd3Q9WU40 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lemd3Q9WU40 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lemd3Q9WU40 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lemd3Q9WU40 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lemd3Q9WU40 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lemd3Q9WU40 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lemd3Q9WU40 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lemd3Q9WU40 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lemd3Q9WU40 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lemd3Q9WU40 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lemd3Q9WU40 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lemd3Q9WU40 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lemd3Q9WU40 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lemd3Q9WU40 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lemd3Q9WU40 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Lemd3Q9WU40 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lemd3Q9WU40 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lemd3Q9WU40 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lemd3Q9WU40 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lemd3Q9WU40 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lemd3Q9WU40 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lemd3Q9WU40 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lemd3Q9WU40 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lemd3Q9WU40 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Lemd3Q9WU40 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lemd3Q9WU40 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lemd3Q9WU40 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lemd3Q9WU40 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Lemd3Q9WU40 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lemd3Q9WU40 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lemd3Q9WU40 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lemd3Q9WU40 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Lemd3Q9WU40 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Lemd3Q9WU40 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms