Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms