Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp18Q9WTV6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp18Q9WTV6 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp18Q9WTV6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp18Q9WTV6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp18Q9WTV6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp18Q9WTV6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp18Q9WTV6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp18Q9WTV6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp18Q9WTV6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp18Q9WTV6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp18Q9WTV6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp18Q9WTV6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp18Q9WTV6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp18Q9WTV6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp18Q9WTV6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp18Q9WTV6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp18Q9WTV6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp18Q9WTV6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp18Q9WTV6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp18Q9WTV6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp18Q9WTV6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp18Q9WTV6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp18Q9WTV6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp18Q9WTV6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp18Q9WTV6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp18Q9WTV6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp18Q9WTV6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp18Q9WTV6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp18Q9WTV6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp18Q9WTV6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp18Q9WTV6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp18Q9WTV6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp18Q9WTV6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp18Q9WTV6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp18Q9WTV6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp18Q9WTV6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Usp18Q9WTV6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Usp18Q9WTV6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Usp18Q9WTV6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
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Usp18Q9WTV6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Usp18Q9WTV6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Usp18Q9WTV6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Usp18Q9WTV6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Usp18Q9WTV6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Usp18Q9WTV6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms