Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTK8

Spo11, Meiotic recombination protein SPO11, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spo11Q9WTK8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spo11Q9WTK8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spo11Q9WTK8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spo11Q9WTK8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spo11Q9WTK8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spo11Q9WTK8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spo11Q9WTK8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spo11Q9WTK8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spo11Q9WTK8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spo11Q9WTK8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spo11Q9WTK8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spo11Q9WTK8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spo11Q9WTK8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spo11Q9WTK8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spo11Q9WTK8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spo11Q9WTK8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spo11Q9WTK8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spo11Q9WTK8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spo11Q9WTK8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spo11Q9WTK8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spo11Q9WTK8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spo11Q9WTK8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spo11Q9WTK8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spo11Q9WTK8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spo11Q9WTK8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spo11Q9WTK8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spo11Q9WTK8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spo11Q9WTK8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spo11Q9WTK8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spo11Q9WTK8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spo11Q9WTK8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spo11Q9WTK8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spo11Q9WTK8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spo11Q9WTK8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spo11Q9WTK8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Spo11Q9WTK8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spo11Q9WTK8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spo11Q9WTK8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spo11Q9WTK8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spo11Q9WTK8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Spo11Q9WTK8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spo11Q9WTK8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Spo11Q9WTK8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spo11Q9WTK8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spo11Q9WTK8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spo11Q9WTK8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spo11Q9WTK8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spo11Q9WTK8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spo11Q9WTK8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spo11Q9WTK8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms