Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam50bQ9WTJ8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam50bQ9WTJ8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam50bQ9WTJ8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam50bQ9WTJ8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam50bQ9WTJ8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam50bQ9WTJ8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms