Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms