Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Y8

Gabrg1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrg1Q9R0Y8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrg1Q9R0Y8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms