Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q8

Clec4e, C-type lectin domain family 4 member E, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4eQ9R0Q8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms