Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed2Q9R0Q3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms