Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms