Protein–RNA interactions for Protein: Q9R061

Nubp2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp2Q9R061 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms