Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZV9

Nxt1, NTF2-related export protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxt1Q9QZV9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nxt1Q9QZV9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nxt1Q9QZV9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nxt1Q9QZV9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nxt1Q9QZV9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nxt1Q9QZV9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nxt1Q9QZV9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nxt1Q9QZV9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nxt1Q9QZV9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nxt1Q9QZV9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nxt1Q9QZV9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nxt1Q9QZV9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nxt1Q9QZV9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nxt1Q9QZV9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nxt1Q9QZV9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nxt1Q9QZV9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nxt1Q9QZV9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nxt1Q9QZV9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nxt1Q9QZV9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nxt1Q9QZV9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nxt1Q9QZV9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nxt1Q9QZV9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nxt1Q9QZV9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nxt1Q9QZV9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nxt1Q9QZV9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms