Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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