Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms