Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZB6

Nr4a3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a3Q9QZB6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr4a3Q9QZB6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr4a3Q9QZB6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr4a3Q9QZB6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr4a3Q9QZB6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr4a3Q9QZB6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr4a3Q9QZB6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr4a3Q9QZB6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr4a3Q9QZB6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr4a3Q9QZB6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr4a3Q9QZB6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr4a3Q9QZB6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr4a3Q9QZB6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr4a3Q9QZB6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr4a3Q9QZB6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr4a3Q9QZB6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr4a3Q9QZB6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr4a3Q9QZB6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr4a3Q9QZB6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr4a3Q9QZB6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr4a3Q9QZB6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr4a3Q9QZB6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms