Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ11

Exo1, Exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo1Q9QZ11 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exo1Q9QZ11 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms