Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms