Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms