Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms