Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms