Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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