Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms