Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms