Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mid2Q9QUS6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mid2Q9QUS6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mid2Q9QUS6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mid2Q9QUS6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mid2Q9QUS6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mid2Q9QUS6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mid2Q9QUS6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mid2Q9QUS6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mid2Q9QUS6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mid2Q9QUS6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mid2Q9QUS6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Mid2Q9QUS6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mid2Q9QUS6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mid2Q9QUS6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mid2Q9QUS6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mid2Q9QUS6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mid2Q9QUS6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mid2Q9QUS6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mid2Q9QUS6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mid2Q9QUS6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mid2Q9QUS6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mid2Q9QUS6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mid2Q9QUS6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mid2Q9QUS6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mid2Q9QUS6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mid2Q9QUS6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mid2Q9QUS6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mid2Q9QUS6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mid2Q9QUS6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mid2Q9QUS6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms