Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUP5

Hapln1, Hyaluronan and proteoglycan link protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hapln1Q9QUP5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hapln1Q9QUP5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hapln1Q9QUP5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hapln1Q9QUP5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hapln1Q9QUP5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hapln1Q9QUP5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hapln1Q9QUP5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hapln1Q9QUP5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hapln1Q9QUP5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hapln1Q9QUP5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hapln1Q9QUP5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hapln1Q9QUP5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hapln1Q9QUP5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hapln1Q9QUP5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hapln1Q9QUP5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hapln1Q9QUP5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hapln1Q9QUP5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hapln1Q9QUP5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hapln1Q9QUP5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hapln1Q9QUP5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hapln1Q9QUP5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hapln1Q9QUP5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hapln1Q9QUP5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hapln1Q9QUP5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hapln1Q9QUP5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hapln1Q9QUP5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hapln1Q9QUP5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hapln1Q9QUP5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hapln1Q9QUP5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hapln1Q9QUP5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hapln1Q9QUP5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hapln1Q9QUP5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hapln1Q9QUP5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hapln1Q9QUP5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms