Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psma6Q9QUM9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms