Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms