Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms