Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms