Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms