Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms