Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms