Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms