Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms