Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms