Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2Q9JKK7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmod2Q9JKK7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmod2Q9JKK7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmod2Q9JKK7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmod2Q9JKK7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmod2Q9JKK7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmod2Q9JKK7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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Tmod2Q9JKK7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmod2Q9JKK7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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Tmod2Q9JKK7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmod2Q9JKK7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmod2Q9JKK7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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Tmod2Q9JKK7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmod2Q9JKK7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmod2Q9JKK7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmod2Q9JKK7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmod2Q9JKK7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmod2Q9JKK7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
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Tmod2Q9JKK7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmod2Q9JKK7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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Tmod2Q9JKK7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmod2Q9JKK7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmod2Q9JKK7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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Tmod2Q9JKK7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmod2Q9JKK7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Tmod2Q9JKK7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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Tmod2Q9JKK7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmod2Q9JKK7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmod2Q9JKK7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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Tmod2Q9JKK7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmod2Q9JKK7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmod2Q9JKK7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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Tmod2Q9JKK7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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Tmod2Q9JKK7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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Tmod2Q9JKK7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod2Q9JKK7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod2Q9JKK7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod2Q9JKK7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod2Q9JKK7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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Tmod2Q9JKK7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod2Q9JKK7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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Tmod2Q9JKK7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod2Q9JKK7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod2Q9JKK7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod2Q9JKK7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod2Q9JKK7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms