Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cnga3Q9JJZ8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms