Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bco1Q9JJS6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bco1Q9JJS6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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Bco1Q9JJS6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bco1Q9JJS6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Bco1Q9JJS6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bco1Q9JJS6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bco1Q9JJS6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bco1Q9JJS6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Bco1Q9JJS6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Bco1Q9JJS6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bco1Q9JJS6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bco1Q9JJS6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bco1Q9JJS6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bco1Q9JJS6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Bco1Q9JJS6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Bco1Q9JJS6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bco1Q9JJS6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Bco1Q9JJS6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bco1Q9JJS6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Bco1Q9JJS6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bco1Q9JJS6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bco1Q9JJS6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bco1Q9JJS6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Bco1Q9JJS6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Bco1Q9JJS6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Bco1Q9JJS6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Bco1Q9JJS6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bco1Q9JJS6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bco1Q9JJS6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bco1Q9JJS6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bco1Q9JJS6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bco1Q9JJS6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bco1Q9JJS6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bco1Q9JJS6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bco1Q9JJS6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Bco1Q9JJS6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Bco1Q9JJS6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Bco1Q9JJS6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bco1Q9JJS6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Bco1Q9JJS6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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