Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN4

Oxct2a, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 2A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oxct2aQ9JJN4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Oxct2aQ9JJN4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Oxct2aQ9JJN4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Oxct2aQ9JJN4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Oxct2aQ9JJN4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Oxct2aQ9JJN4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Oxct2aQ9JJN4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Oxct2aQ9JJN4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Oxct2aQ9JJN4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Oxct2aQ9JJN4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Oxct2aQ9JJN4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Oxct2aQ9JJN4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Oxct2aQ9JJN4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Oxct2aQ9JJN4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Oxct2aQ9JJN4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Oxct2aQ9JJN4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Oxct2aQ9JJN4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Oxct2aQ9JJN4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Oxct2aQ9JJN4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Oxct2aQ9JJN4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Oxct2aQ9JJN4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Oxct2aQ9JJN4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Oxct2aQ9JJN4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Oxct2aQ9JJN4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Oxct2aQ9JJN4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Oxct2aQ9JJN4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Oxct2aQ9JJN4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Oxct2aQ9JJN4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Oxct2aQ9JJN4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Oxct2aQ9JJN4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Oxct2aQ9JJN4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Oxct2aQ9JJN4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms