Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smad9Q9JIW5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms